Добрый день.  Требуйте у инспектора письменный отказ, в котором он пусть  укажет основания отказа. Пусть подробно напишет на основании, какого пункта, какой статьи, какого законодательного акта он отказывает Вам в регистрации катера.
Если инспектор отказывается это сделать, то обратитесь к главному государственному инспектору по маломерным судам Вашего региона с жалобой и потребуйте у него этот письменный отказ. Или задайте вопрос начальнику Главного управления МЧС России по Оренбургской области здесь.  Он точно разберется. Если нет – придется защищать свои интересы в суде.

Кстати Вы можете получить государственную услугу по регистрации маломерного судна на WEB сайте Портала электронных услуг "Электронного Правительства"

Так ему уже указали основание:Приказ 500. И 36-ФЗ, вернее измененнные им КТМ и КВВТ не помогут, т.к. там написано "оганами уполномоченными Правительством", и пока ГИМС никто не уполномачивал регистрировать суда внутреннего плавания с мощностью более 55 кВт. Больше года прошло, а подзаконные НПА остались в прежнем состоянии. Остается, как и прежде, возможность регистрации такого судна как морского прогулочного. Возможно оно так и было зарегистрированно, но вряд ли руководство ГИМС будет оспаривать требование прокурора, легче  выполнить, даже если оно не законно.